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Con el fin de estimular la participación de jóvenes en actividades científicas, el Museo de Ciencias ha desarrollado la tradición de realizar concursos de Investigación (Licenciatura), Creatividad (Preparatoria) y Curiosidad Científica (Primaria y Secundaria). Para cada concurso se integran jurados con distinguidos académicos universitarios, encargados de evaluar los trabajos, determinar a los ganadores y enriquecer los esfuerzos científicos de los participantes. La pandemia de Covid-19 obligó a suspender estas actividades por un par de años, pero ya se trabaja para reanudarlas.